同房时肚子痛、腰痛通常是由于姿势不正确、过度疲劳、腹部着凉、盆腔炎、子宫内膜异位症等因素导致的。建议及时就医，在医生的指导下进行对症治疗。
1. 姿势不正确：在同房过程中，若姿势不当，可能会导致身体某些部位受力不均，肌肉和韧带过度拉伸或受压。比如某些高难度姿势，会使腹部和腰部的肌肉紧张，从而引发疼痛。建议尝试采用较为舒适自然的姿势，如传统的男上女下体位。
2. 过度疲劳：如果近期身体过于劳累，精力不足，在同房时体能跟不上，肌肉容易出现酸痛。比如连续加班、重体力劳动后，身体还未恢复就进行同房，腹部和腰部肌肉会因疲劳而产生疼痛。应保证充足休息，规律作息，适当进行轻松的运动如散步来恢复体力。
3. 腹部着凉：当腹部受寒时，血管收缩，血液循环变差，肌肉容易痉挛。比如在空调房里衣着单薄，同房时腹部和腰部的肌肉因寒冷刺激而收缩疼痛。可以通过热敷腹部和腰部来缓解，比如使用热水袋，并且注意保暖，增添衣物。
4. 盆腔炎：盆腔炎是女性盆腔生殖器官及周围组织的炎症。炎症刺激盆腔组织和韧带，性生活时盆腔充血，会加重炎症反应，从而引起肚子痛和腰痛。症状可能还有下腹坠胀、白带异常等。治疗可使用抗生素，如头孢曲松钠注射液、甲硝唑注射液等，也可进行物理治疗，如热敷。遵医嘱用药。
5. 子宫内膜异位症：子宫内膜异位症是子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位。异位的内膜在性生活时受刺激，导致子宫收缩和盆腔内压力变化，引发肚子痛和腰痛。常有痛经、月经异常等表现。治疗可用醋酸曲普瑞林注射液、屈螺酮炔雌醇片等药物，或进行手术治疗。遵医嘱用药。
除上述原因外，还可能是生殖器官受压，子宫肌瘤，卵巢囊肿等原因导致的同房时肚子痛、腰痛。建议先暂停同房，注意休息和保暖。若疼痛持续不缓解或加重，应及时就医。就医时可进行妇科检查、B 超等，以明确病因，对症治疗。平时注意个人卫生，避免过度劳累。