同房时右边腰部疼且不舒服通常是由于姿势不正确、腰部肌肉劳损、泌尿系统结石、盆腔炎、附件炎等因素导致的。建议及时就医，在医生的指导下进行对症治疗。
1. 姿势不正确：在同房时，如果姿势不当，可能导致身体重心偏移，右侧腰部受力不均，肌肉过度拉伸或收缩。症状表现为突然的疼痛和不适感。可通过调整姿势，如采用更舒适自然的体位，避免过度扭曲身体，平时多进行瑜伽中的平衡体式练习来改善。
2. 腰部肌肉劳损：长期劳累或频繁的腰部活动，易造成腰部肌肉损伤。症状为腰部酸痛、胀痛，活动时加重。建议加强腰部肌肉锻炼，如进行小燕飞动作，每日三组，每组 10 次。还可对腰部进行热敷，每次 15 – 20 分钟，促进血液循环。
3. 泌尿系统结石：结石在泌尿系统移动时刺激组织，引起疼痛。疼痛可能较剧烈，还可能伴有血尿。要多喝水，每天至少 2000 毫升，以促进结石排出。多进行跳绳运动，利用震动促使结石下移。同时注意饮食，减少高草酸食物摄入。
4. 盆腔炎：盆腔炎是女性盆腔生殖器官及其周围结缔组织的炎症。炎症刺激盆腔组织，引起盆腔充血、水肿，同房时盆腔受到刺激，牵扯到腰部神经，就会出现右边腰部疼且不舒服。治疗可口服甲硝唑片、左氧氟沙星片、头孢克肟分散片等，同时配合物理治疗，注意休息，遵医嘱用药。
5. 附件炎：附件炎指输卵管和卵巢的炎症。炎症会导致附件组织粘连、肿胀，同房时刺激到病变部位，引起右侧腰部牵涉痛。治疗可用阿奇霉素分散片、阿莫西林胶囊、多西环素片。日常要注意个人卫生，增加营养，适当锻炼，增强体质，用药需遵医嘱。
除上述原因外，还可能是生殖系统畸形，腰椎间盘突出，右肾囊肿等原因导致的同房时右边腰部疼且不舒服。建议减少同房频率，避免过度劳累。注意腰部保暖，可适当热敷。若症状持续不缓解或加重，应及时就医，进行全面检查，如腰部 CT、生殖系统超声等，以明确病因。