天生少一颗牙可能与遗传有关。由于牙胚在发育过程中先天缺失，导致天生就少一颗牙。
另外一种情况可能是口腔检查的时候发现少了一颗牙，可能少的牙齿埋伏在颌骨里没有萌出、没有发现，去正规医院口腔科拍曲面断层摄影，才发现牙齿没有萌出，包括牙齿的异常或者是没有足够的空间萌出，所以先天少一颗牙。
先天少一颗牙可以去医院检查，通过拍片可以分辨是先天缺失还是阻生。牙胚发育初期，母体的营养障碍，如铁、钙、蛋白质缺乏和内分泌的失调等，可能都会造成先天性缺牙或者牙齿没有萌出。如果是埋伏阻生牙，可以考虑手术切除。
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