一般情况下，吃了紧急避孕药肚子疼可能是由于激素水平波动、子宫收缩、个体对药物敏感、胃肠道刺激、盆腔炎等原因引起的。常见的治疗方法有休息、热敷、喝温水、按摩、就医检查。如果吃了紧急避孕药后肚子疼，建议及时就医，明确原因后，在专业医生的指导下进行治疗。
1. 激素水平波动:紧急避孕药含有大量激素，服用后体内激素水平会突然改变。激素的波动可能会影响子宫内膜的状态，导致子宫出现不规则收缩，从而引起肚子疼。对应的治疗方法有休息，减少活动量，让身体适应激素的变化；还可以通过热敷腹部，促进局部血液循环，缓解肚子疼。
2. 子宫收缩:紧急避孕药可能会刺激子宫平滑肌收缩，这种收缩类似于痛经时的子宫收缩，会引发肚子疼。治疗方法包括喝温水，温水能舒缓身体的不适感；也可以进行腹部按摩，按照顺时针方向轻柔按摩腹部，减轻子宫收缩带来的疼痛。
3. 个体对药物敏感:不同个体对紧急避孕药的反应不同，有些人可能对药物中的成分比较敏感，服用后身体会出现肚子疼等不良反应。针对这种情况，可以休息，避免剧烈运动，让身体自行缓解；也可以通过热敷来减轻肚子疼的症状。
4. 胃肠道刺激:紧急避孕药可能会对胃肠道产生刺激，引起胃肠道痉挛，进而导致肚子疼。治疗方法有喝温水，温暖胃肠道，缓解痉挛；还可以通过休息，减少胃肠道的负担，缓解肚子疼。
5. 盆腔炎:如果本身患有盆腔炎，紧急避孕药可能会加重炎症反应，导致肚子疼加剧。对于盆腔炎，需要就医，在医生的指导下使用阿莫西林、阿奇霉素等药物进行治疗，处方药需遵医嘱使用。
除了上述原因还有可能由子宫内膜异位症、附件炎、肠道寄生虫感染等原因引起。如果吃了紧急避孕药后肚子疼，不要自行服用止痛药物，避免掩盖病情；要注意观察肚子疼的程度、持续时间、是否伴有其他症状如阴道出血、头晕等，如果症状严重或者持续不缓解，要尽快就医。