月经后第三天腰痛通常是由于腰部着凉受寒、过度劳累久坐、激素水平波动、盆腔炎、子宫内膜炎等因素导致的。建议及时就医，在医生的指导下进行对症治疗。
1. 腰部着凉受寒：月经后身体相对虚弱，此时若腰部保暖不当，寒气易侵入。会出现腰部冷痛，肌肉紧张。可通过热敷腰部来缓解，比如使用热毛巾或暖水袋，每次 20 分钟左右，每天多次。也可适当喝些姜汤，驱除体内寒气。
2. 过度劳累久坐：经期后身体未完全恢复，若长时间保持坐姿或过度劳累，腰部肌肉负担加重。表现为腰部酸痛、僵硬。应定时起身活动，如每半小时站立走动几分钟，做简单的腰部伸展运动，如转腰、伸懒腰，晚上用热水泡脚促进血液循环。
3. 激素水平波动：月经后体内激素水平变化，可能影响腰部组织代谢和神经功能。常伴有腰部隐隐作痛。此时需保持良好作息，保证充足睡眠，每晚至少 7 小时。睡前可进行轻柔的腰部按摩，从脊椎两侧由上往下推按，帮助放松肌肉。
4. 盆腔炎：盆腔炎是女性上生殖道及其周围组织的炎症。月经后腰痛可能是炎症刺激盆腔组织，导致盆腔充血、水肿，牵扯到腰部神经。症状常有下腹疼痛、坠胀，腰部酸痛等。治疗可采用抗生素如头孢曲松钠注射液，也可用中成药如妇炎康片，还可服用甲硝唑片。遵医嘱用药。
5. 子宫内膜炎：子宫内膜炎是子宫内膜的炎症。月经后子宫内膜修复过程中，炎症刺激可引起子宫收缩，牵涉腰部产生疼痛。常有下腹疼痛、白带异常等表现。可口服左氧氟沙星片抗感染，服用妇科千金片改善症状，或用醋酸甲羟孕酮片调节内分泌。务必遵医嘱用药。
除上述原因外，还可能是子宫后位牵拉，腰肌劳损，腰椎间盘突出等原因导致的月经后第三天间腰痛。建议多休息，避免劳累和剧烈运动，注意腰部保暖。若腰痛持续不缓解或加重，应及时就医，进行妇科检查、腰部影像学检查等，以明确病因，对症治疗。