一般情况下，经期同房后小便刺痛可能是由于尿道黏膜受损、细菌感染、尿道炎、膀胱炎、肾盂肾炎等原因引起的。常见的治疗方法有多喝水、注意个人卫生、避免再次经期同房、热敷、使用外用洗剂。如果出现这种情况，建议及时就医，明确原因后，在专业医生的指导下进行治疗。
1. 尿道黏膜受损:经期同房时，由于外力作用，可能会导致尿道黏膜受到摩擦而受损。尿道黏膜受损后，尿液刺激会引起刺痛感。治疗上，首先要避免再次刺激，比如停止经期同房。同时要注意个人卫生，保持尿道口清洁，可使用温水清洗。
2. 细菌感染:经期女性的生殖系统较为脆弱，同房容易带入细菌，细菌滋生繁殖后可能引发炎症，导致小便刺痛。治疗时，要注意局部清洁，可使用复方黄柏液等外用洗剂清洗，同时要多喝水，促进细菌排出，必要时可根据医嘱使用阿莫西林、呋喃妥因等药物进行抗感染治疗，处方药需在医生指导下使用。
3. 尿道炎:经期同房可能引发尿道炎，炎症刺激尿道黏膜，产生刺痛感。对于尿道炎，要大量饮水，增加尿量，起到冲洗尿道的作用。也可遵医嘱使用三金片、热淋清颗粒等药物，用药需遵循医生的建议。
4. 膀胱炎:同房过程中细菌可能上行感染膀胱，加上经期女性抵抗力下降，容易诱发膀胱炎。在治疗方面，患者要多休息，避免劳累。同时可进行热敷耻骨上膀胱区，缓解疼痛，也可根据医生的诊断使用诺氟沙星、氧氟沙星等药物，这些药物必须在医生的指导下使用。
5. 肾盂肾炎:如果细菌进一步上行，可能引发肾盂肾炎，这种情况下也会出现小便刺痛。治疗上，患者需要卧床休息，同时要摄入足够的水分。可在医生的指导下使用头孢克肟、阿奇霉素等药物进行治疗。
除了上述原因还有可能由泌尿系统结石、过敏等原因引起。出现经期同房后小便刺痛的情况，在就医前要避免自行用药，以免掩盖病情。要注意休息，避免剧烈运动，同时要保持外阴清洁，不要吃辛辣刺激性食物，这些都有助于缓解症状。